No encontramos antecedentes históricos que nos hablen de esta iglesia, suponemos que data del siglo XIX, aunque conserva una Dolorosa y un Nazareno de mayor antigüedad.
Lagunillas es un poblado que vive de la agricultura y su mayor auge surgió el siglo pasado con la cría de ganado de lidia propiciada por los hacendados de la región. La iglesia se compone de capilla y troje anexas, que formaban parte de la antigua hacienda de lagunillas que existe desde fines de la colonia.
El atrio fue recientemente pavimentado, al mismo tiempo que se remodeló la iglesia que estuvo a punto de ser demolida en 1988, fecha en que se turnó una solicitud para tal efecto y que fue denegada.
La fachada es lisa, en un solo paño aplanado en blanco con rodapié almagre, la portada consiste en un sencillo vano de medio punto con el extradós decorado mediante una moldura al centro; dos pilastras planas desplantadas de basas lisas y cortadas por un capitel toscano se prolongan hasta el sencillo cornisamento que remata el acceso.
La ventana coral es rectangular, y se remarca con aplanado formando un rectángulo realzado. El imafronte es triangular siguiendo la pendiente a dos aguas de la techumbre, en el vértice se encuentra una cruz de cantera.
La torre al extremo derecho de la nave se desplanta de un cubo liso con el acceso al frente, cuatro amplias pilastras soportan la cubierta de madera y teja a cuatro aguas.
La nave es rectangular de ábside poligonal, carece de altar en el muro testero que fue recubierto recientemente por tablones de madera que forman un lambrín con dos nichos cuadrados en los que vemos a La Inmaculada Concepción y a San José.
El altar consiste en un elemento de madera de paramentos curvos, moderno, anástilo, sobre el que se encuentra una imagen de Cristo Rey de pie sobre el mundo. Los muros son de adobe, cuando los conocimos hace 14 años, lucían un bello enjarre que armonizaba con la imagen del poblado, hoy están recubiertos de mezcla terciada con vinílicas tanto en el interior como en el exterior, amplias ventanas rectangulares iluminan el espacio interior, carente de altares y de imágenes de interés artístico, a excepción del Nazareno y la Dolorosa colocados detrás de un cancel en un nicho intramuros que los hacen ver como en una cárcel. La humedad por capilaridad de los muros se recubrió con un lambrín de madera que corre a todo lo largo de la nave; el resto está pintado en blanco con franjas grises que obscurecen el ambiente.
El coro al pie de la nave está conformado con viguería y recubierto con duela pintada, de igual manera la techumbre interior se recubre con un enduelado decorado con una cenefa de flores de acanto y pintura blanca de fondo a la manera neoclásica. El piso es de mosaico corriente. Al exterior la techumbre es de triángulo con armadura de madera, fajilla y teja.
La casa cural es de adobe y techo de teja, aunque el interior ha sido modificado con muros y columnas de tabique y concreto respectivamente.
