El poblado de Pixoy fue una de las comunidades más dañadas por el episodio de la guerra de castas hacia 1850 que fue la época en que se cree que el templo fue severamente dañado.
Actualmente se le ha reconstruido la sacristía y una sección de la nave en la parte delantera. El presbiterio, la parte posterior de la nave, y la pieza al norte del presbiterio fueron derruidas así como la cubierta que se cree fue de palmas.
La siguiente información fue tomada textualmente del Catálogo de Construcciones Religiosas del estado de Yucatán. Editado por la Secretaría de Hacienda y Crédito Público. Dirección General de Bienes Nacionales. Formada por la Comisión de Inventarios de la Cuarta Zona 1929 - 1933. Recopilado por Justino Fernández.
"PIXOY
MUNICIPIO DE VALLADOLID
SANTA ANA
HISTORIA. Se ignora la fecha en que fue edificado este templo, lo único que se sabe es que la casa cural se cayó hace 50 años y el techo del templo, hace 20 años aproximadamente.
DESCRIPCION. La antigua construcción del templo, así como de la casa cural era de mampostería. En la actualidad, de esta construcción sólo quedan los muros laterales y el frente de la iglesia; la casa cural que le era anexa se encuentra caída en su totalidad.
Dentro de lo que constituye el cuerpo del templo en la actualidad, ha sido levantada una pequeña capilla con paredes de setos sin embarro y techo de palmas, sin aprovechar ninguno de los muros de la antigua construcción.
El atrio que le es adyacente, está limitado por un pretil de mampostería en mal estado de conservación. Dentro del mismo y en el ángulo noroeste, ha sido construida una pieza con paredes de setos con embarro y techo de palma, en donde está instalada una escuela.
CONDICIONES MATERIALES. La antigua construcción está en estado ruinoso, la capilla que fue levantada con posterioridad, está en buenas condiciones materiales."
