La cúpula consta de un tambor octagonal rematado por pináculos y cuyas caras alojan cuatro arbotantes y cuatro ventanas enmarcadas con pilastras lisas y frontón triangular; sobre el tambor se apoya la cúpula esférica que estuvo recubierta con ladrillo y azulejos formando soles en color azul y amarillo, y grandes fajas amarillas y azules. Notable es su coronamiento ya que el cupulín tiene decoración y esculturas en argamasa.
Observaciones del bien mueble
A raíz del sismo ocurrido en 1999, la cúpula fue intervenida bajo supervisión del Centro INAH de Puebla. Fue entonces cuando el recubrimiento de ladrillos y azulejos fue retirado.
