El Sagrario, anexo al lado sur de la catedral, fue construido en el siglo XVIII y destruido parcialmente por temblores, siendo el último el terremoto de octubre de 1980; fue reconstruido en 1985. Fue erigido jurídicamente como parroquia dependiente de la diócesis de Huajuapan. Es de una sola nave, separada en cuatro tramos cubiertos con bóveda de casquete, y tiene un ábside semicircular inscrito en el testero poligonal. Esbeltas pilastras y una espadaña de cinco arcos ojivales, como remate, enmarcan la portada barroca de medio punto con frontón semicircular que se rompe para dar cabida a la ventana ojival del coro.
