La capilla de Ahuatlán es de una nave, cuyo presbiterio trapezoidal se encuentra en ruinas. Está construida con gruesos muros ciegos de mampostería, reforzados con contrafuertes, y cubierta con bóveda de cañón corrido. Del frontispicio, solo está aplanado el enmarcamiento del acceso, y tiene, al centro de la parte superior, una espadaña de cuatro vanos de medio punto con pináculos en los extremos. Al lado sur se conservan las ruinas de lo que fue el presbiterio de la capilla abierta.
