Este recinto religioso se sitúa en lo que fue la antigua Hacienda de la Trinidad, dentro del municipio de San Francisco de los Romo. Históricamente, el territorio de este municipio estuvo integrado por la Hacienda de San Blas. En 1829, los señores Francisco Ignacio Romo de Vivar, José Manuel Romo de Vivar y Cesáreo Lozano adquirieron el sitio de Buenavista, repartiéndolo proporcionalmente según su aportación. En este proceso, Cesáreo Lozano fundó el rancho La Noria de la Trinidad, mientras que Francisco Ignacio Romo de Vivar estableció su propio rancho, San Francisco, hacia 1850. Tras el fallecimiento de este último en 1860, al nombre del asentamiento se le añadió su apellido, consolidándose como San Francisco de los Romo. En 1931, el lugar fue elevado a delegación municipal y, finalmente, el 30 de enero de 1992, se aprobó su creación como municipio autónomo bajo la iniciativa del entonces gobernador, el ingeniero Miguel Ángel Barberena Vega (H. Ayuntamiento del municipio de San Francisco de los Romo, 2014).
La Hacienda de la Trinidad tiene sus orígenes en 1829, coincidiendo con el inicio de la fragmentación de los terrenos de San Blas, de los cuales formaba parte el sitio de ganado mayor de Buenavista. Según el cronista local Juan Reyes Castañeda, la capilla fue erigida por órdenes de Justo Lozano, hijo de Cesáreo Lozano. La construcción concluyó en 1850 y fue bendecida el 17 de septiembre del mismo año, contando con la autorización de Diego Aranda, obispo de Guadalajara (Radio y Televisión de Aguascalientes, 2012).
En el interior del edificio, el altar mayor albergaba una pintura de la Santísima Trinidad, advocación que da nombre al templo, junto con una imagen de la Virgen del Refugio. En la actualidad, el inmueble permanece fuera de servicio debido a la necesidad de trabajos de mantenimiento y restauración.
