La capilla de Nuestra Señora del Refugio, ubicada en la ex hacienda de Jaltomate y aislada del casco de la misma, se encuentra sobre una calle que conduce a la casona. La capilla, de construcción muy rústica, data de fines del siglo XIX; fue construida por artesanos bajo la dirección de la familia Camarena, heredera de las tierras de Jaltomate, desmembrada del mayorazgo Rincón Gallardo. Actualmente, está fuera de uso y requiere tratamiento de consolidación en su cubierta y muros, pese a que la original, que era de viguería, fue cambiada a bóveda de arista en los años treinta (datos obtenidos por los actuales dueños que residen en la ex hacienda). Hoy en día, se realizan los trabajos de consolidación con aportación de la comunidad católica a través de un comité.
