El edificio data del siglo XVI, aunque fue remodelado en el XIX.
El cura y juez eclesiástico, el bachiller Pedro Joséph de Velasco, de la villa de San Juan Tzitacuaro, responde al informe descriptivo de los pueblos y dice que se componían en 1765 de once pueblos: "... a la distancia de una legua está el de San Andrés, tiene iglesia capaz y muy fuerte porque es de mampostería, pero tan destituida de ornamentos y vasos sagrados que cuando se celebra en él es preciso que todo vaya de la cabecera...".
Don Manuel Rivera Cambas nos dice que esta región fue evangelizada por los frailes de San Francisco, que residían en su convento de Zitacuaro, quienes fundaron la capilla del entonces pueblo de San Andrés de Jilotepec. Seguramente este sitio sufrió suerte similar al de San Juan Tzitacuaro, ya que dio albergue a las fuerzas de Rayón durante la gesta independentista, según podemos observar, ya que el inmueble religioso conserva de original solo los muros y las jambas de la fachada.
El atrio es una extensa área cubierta de pasto, con escasa y raquítica vegetación; se corta en su parte central por un andador de cemento, interrumpido por una peana escalonada que sustenta una cruz sin elementos decorativos. Está delimitado por una barda de piedra sobre la que se apoya una reja de fierro de material contemporáneo, que se fija a pilastras de tabique que surgen en tramos regulares. Frente a la nave se despliega una plazuela vestibular, escalonada siete niveles arriba del atrio.
La fachada, aplanada y pintada en color de rosa, muestra un paramento liso que se corta con una línea horizontal de tabique, sobre la cual se desplanta un frontón delimitado también por una tapa de ladrillo con una cruz en el vértice. La portada se eleva sobre dos escalones en los que se apoyan basas cuadradas lisas y, encima, basas de diseño muy primitivo con dentellones que más parecen flecos. Las jambas son monolíticas, ornamentadas con una talla en forma de palma florida; el capitel denticulado es igual a la basa, lo que indica la antigüedad de ambos. El arco de medio punto presenta dovelas estriadas insertas en una media caña, tanto en el intradós como en el extradós. Dos flores ornamentan los riñones del arco, que se corona en toda la extensión de la portada por una doble cornisa moldurada, sobre la que se eleva la ventana del coro, que conserva aún parte de su primitivismo en su dintel y el repisón de desplante. A los lados se observan dos columnillas toscanas; es notoria la alteración del vano, que, pese al frontón trunco que lo remata y el desfase de las dovelas del dintel, no deja de ser interesante. Entre las dos cornisas paralelas vemos tres círculos de obsidiana, indicando el simbolismo prehispánico que, pese a las remodelaciones, no fue eliminado.
La puerta es un elemento metálico con fijo interior y herrería de cuadros con cristal, pintada en azul, que desmerece del arco que la enmarca.
La torre fue adosada posteriormente; se eleva desde un basamento cuadrado con una ventana mixtilínea granadina que ilumina el interior. Una gruesa cornisa con ánforas de crátera en las esquinas separa los dos cuerpos superiores, de igual diseño, con arcos de medio punto sobre impostas y jambas lisas en cantera gris, que se flanquean por pilastras toscanas; remata con un cupulín terminado en una esfera.
La nave es de un solo cuerpo, con ábside poligonal, delimitada por gruesos muros de mampostería aparente, reforzados por gruesos contrafuertes. En el lado sur puede verse la escalera adosada al paramento, que permite el acceso al coro, hecha en piedra. Por el interior, los muros fueron despojados de su recubrimiento, adquiriendo un ambiente húmedo y oscuro; se iluminan precariamente por dos vanos rectangulares y dos óculos en el presbiterio. Al fondo, en el ábside, destaca un altar ecléctico formado por un cuerpo y tres calles que se separan a través de columnas con capitel anástilo; en los dos laterales hay un nicho de medio punto y en el central, un templete de cubierta abovedada. Las columnas soportan el entablamento de friso, rematándose en cada eje almenas de crátera. En la parte superior, en un nicho también de medio punto, está la imagen en escultura de San Andrés; de igual modo que el resto de la nave, el altar fue despojado de sus acabados, adquiriendo un desagradable aspecto.
El piso es de mosaico, con grecas en los peraltes, que deterioran aún más la imagen interior de la nave. Sobre el acceso se ubica el coro de vigas con tablones apoyados sobre ménsulas moriscas que sustentan la gualdra principal; se delimita por un barandal torneado.
La techumbre es, en el presbiterio, una bóveda con un rosetón al centro, que se delimita mediante el arco triunfal. La nave se cubre con viguería plana, formando un plafón que carece de ménsulas o canes y arrastre de desplante. Recientemente fue remodelado el interior, quedando la madera con un acabado tan oscuro que deteriora aún más el aspecto interior; por el exterior se cubre con una estructura de madera recubierta de lámina galvanizada.
