El convento pertenece a la provincia de San Diego de México de la Orden de los Franciscanos Descalzos. Fue fundado en 1640 bajo la advocación de San José, y la iglesia fue reconstruida más tarde, en 1633, por petición de doña Catalina Calderón. Después, la advocación pasó a ser la de Santa Bárbara y hoy se conoce por San Diego. El edificio sirvió de cuartel general al heroico Morelos durante el sitio que puso Calleja a la población, de febrero a mayo de 1812.
Según datos tomados de la declaratoria de monumentos, no se tuvo ningún respeto por esos muros que abrigaron a tantos héroes en tiempos difíciles, y el convento fue convertido en estación de ferrocarriles desde el 8 de junio de 1881. El claustro está ocupado por viviendas torpemente organizadas.
Un atrio pequeño, rodeado por una barda de arcos invertidos, nos conduce a la iglesia.
La portada consta de dos cuerpos. Al primero corresponde el arco de entrada, que es de medio punto, cuya arquivolta se adorna con recuadros. A cada lado existe una columna adosada. Descansan sobre una alta base; su fuste es estriado, con capitel de estilo corintio.
Sobre el arco existe un entablamento formado por un arquitrabe, friso con metopas y triglifos, y una cornisa. En esta última descansa un remate con un escudo central limitado por roleos. de este remate arranca la ventana del coro, que constituye el segundo cuerpo. Está enmarcada por pilastras estriadas a los lados y molduras en la parte superior. Remata la portada un frontón truncado por una cruz.
La fachada está coronada por un imafronte de sección circular. La torre se encuentra al lado izquierdo de la iglesia. Consta de dos cuerpos de planta cuadrada; el segundo, más pequeño que el primero, tiene un remate piramidal.
La iglesia es de una sola nave, techada con bóveda de arista. El ábside es de forma poligonal y presenta una especie de concha en su parte superior. La cúpula que cubre el presbiterio es octagonal y descansa sobre un tambor en el cual se abren las ventanas que permiten la iluminación de la iglesia. Exteriormente, el ábside presenta contrafuertes.
Comunicada con esta iglesia hay una capilla de planta rectangular; es de una sola nave, con ábside semicircular. Los muros son lisos y de color blanco. Sobre el presbiterio se alza una cúpula octagonal con un tambor bajo que, exteriormente, presenta pequeños contrafuertes, almenas y arcos botareles. La cúpula remata en linternilla.
La portada lateral que da acceso a la capilla muestra una puerta muy alargada en el primer cuerpo; en el segundo se encuentra la ventana de coro, decorada con volutas.
El convento está situado a la derecha de la iglesia. La entrada, con arcos y paredes con nichos, introduce al claustro, que es pequeño, con doble galería, pero se encuentra en muy mal estado. Los vanos de los corredores son de medio punto. Las galerías están divididas en tramos por bóvedas de arista, que se continúan en pilastras. Las celdas, que están en el segundo piso, son de medianas dimensiones, con techos planos, y cada una posee una ventanita que da al exterior.
