A este templo se le llama "La Profesa" porque en él residían los profesos jesuitas del cuarto voto (obediencia al Papa). En 1597 se inició el primitivo templo. El 31 de julio de 1610 se consagró la iglesia. La conclusión de la obra del nuevo templo, a cargo del arquitecto Pedro de Arrieta, se realizó el 28 de abril de 1720. En 1771, después de la expulsión de los jesuitas, se permuta el oratorio de los felipenses por la casa y templo de La Profesa, por acuerdo del virrey marqués de la Croix.
En 1914, un incendio destruyó las pinturas de la cúpula que había realizado Pelegrín Clavé.
Nuestra Señora de las Nieves es la patrona del Oratorio de San Felipe Neri.
