Este templo dedicado a San Francisco se ubica dentro de la periferia del centro de la Ciudad de Zacatecas, se encuentra dentro del conjunto del Ex Convento de San Francisco y al igual que este, el templo se construyó en 1567 teniendo una segunda etapa de construcción en 1649 debido a un incendio. El templo quedó en el abandono cuando los Franciscanos salieron debido a las
Leyes de Reforma pero el templo siguió en uso hasta 1924, cuando ocurrió el derrumbe de las bóvedas. El acceso principal al conjunto a través de una plaza de para entrar al jardín el cual da acceso al templo que esta perpendicular. Desde el jardín apreciamos la fachada se compone de tres cuerpos sostenidos por cuatro columnas que enmarcan los nichos. Los cuerpos están divididos por cornisas que presentan ornamentación con elementos vegetales. El primer cuerpo presenta columnas de capitel corintio en ambos lados con fuste estriado, entre las columnas se pueden observar nichos, con peanas y rematadas con conchas en la parte superior. El acceso principal es puerta de madera labrada enmarcada con un arco de medio punto de piedra labrada con el escudo de la orden de los Franciscanos. En el segundo cuerpo observamos cuatro pilastras salomónicas ornamentadas con elementos vegetales en el fuste y con capitel de orden
corintio, las pilastras enmarcan a los costados dos nichos y en el centro un vano de forma hexagonal con un marco ornamentado de igual manera con elementos vegetales. El tercer cuerpo cuenta con un nicho al centro flanqueado por pilastras salomónicas, se puede suponer que el remate es mixtilíneo. También cuenta con una torre de campanario situada al sur, la cual está
parcialmente destruida.
La planta es de una sola nave y se divide en seis entre ejes con columnas de estilo dórico de las que se desplantan arcos de medio punto en los que se observa como ornamentación el escudo Franciscano. Observamos como parte de los trabajos de restauración largueros como refuerzos de acero que contienen el empuje de los arcos. Las bóvedas de la cubierta son de pañuelo y
también se encuentran en gran parte destruidas. Completa la cubierta una cúpula de forma octagonal con linternilla de cantera rosa. También cuenta con anexos a los costados, en el costado norte se encuentra el bautisterios y la sacristía, por medio de un acceso con una escalinata y techada con una cúpula de forma octagonal.
En el costado sur se encuentra otro anexo que se puede suponer es una capilla lateral que al igual que la nave principal cuenta en la cubierta con una cúpula octagonal de menor dimensión coronada con una linternilla de cantera rosa.
