La capilla de San Francisco consta de templo, atrio y anexos.
El templo es de planta rectangular, con muros de mampostería de cal y canto, aplanados en el interior y en el paramento de la fachada principal; los muros exteriores están desnudos y, en el testero, se adosaron dos contrafuertes, con cubierta de lámina galvanizada sobre estructura de madera, cielo raso de tablón y piso de mosaico.
El presbiterio está dividido de la nave mediante un escalón que da acceso al altar; en el muro testero se ubica una pila de agua bendita en cantera labrada, así como dos ménsulas de concreto armado con remate en pecho paloma, que soportan dos esculturas de reciente factura, y al centro un crucifijo de madera; del lado derecho de la nave se observa una puerta que comunica a la sacristía; ésta es una construcción posterior al inmueble y tiene muros de block y cubierta de concreto armado; en el muro opuesto del templo se localiza el coro, de manufactura de madera, y al que se accede a través del campanario.
La nave de la capilla recibe luz mediante dos ventanas de forma rectangular ubicadas en los muros laterales, a través de la ventana coral con cerramiento de medio punto y por el óculo del tapanco, ubicado en la parte superior de la fachada principal.
La fachada principal, de paramento liso, contiene el vano de acceso principal con cerramiento de medio punto sobre jambas labradas con formas vegetales en alto relieve; los capiteles cuentan con pequeñas caras de querubines y adornos florales, lo que también se observa en las dovelas; en la parte superior se ubica la ventana coral de forma rectangular con cerramiento de medio punto y, más arriba de ésta, se observa otra ventana circular de pequeñas dimensiones que se localiza a la altura del tapanco, así como el remate triangular de la fachada.
Al paño de la fachada principal, del lado sur, se construyó un campanario de mampostería de cal y canto con tres cuerpos escalonados y, como remate, una linternilla hexagonal rematada con una cruz; en la base se localiza un acceso de forma rectangular por el que se accede también al coro de la capilla; en el segundo y tercer tramo los vanos son de medio punto.
El atrio, de grandes dimensiones, está delimitado por una alambrada; cuenta con acceso por los lados norte y oriente.
El coro contaba con una escalera que ha desaparecido a la fecha, en este espacio se localizan varias piezas de arte de buena factura.
