Edificada a finales del siglo XIX, el bautisterio, que actualmente tiene uso de notaría fue concluido hasta el año de 1911.
La Parroquia de San Francisco de Asís en Huanusco cuenta con una portada trabajada en cantera, dividida en tres secciones que se distinguen entre sí por los cambios en el paramento de fachada, del lado izquierdo tenemos el ya mencionado bautisterio, al centro se observa la portada del templo y del lado derecho se erige la torre campanario, la fachada central, que constituye
la portada del templo se encuentra compuesta por un frontón triangular posado sobre columnas corintias pareadas con fuste liso y estilobatos trabajados en cantera pulida, la base de estos está trabajada en piedra canteada, dentro de este frontón se aprecian dos cuerpos, en la parte baja se observa el acceso principal compuesto por un arco de medio punto, en el arranque de
este último se observan a los costados un par de pilares con capitel sobre los cuales se posa una cornisa que delimita el cuerpo, por encima de este se observa la ventana del coro con proporciones rectangulares, la fachada del bautisterios se encuentra muy sencillamente ornamentada y trabajada con piedra canteada, esta cuenta con una pequeña puerta de proporciones rectangulares al centro y con un remate de arco con tres centros, la torre campanario se encuentra dividida en tres cuerpos, el arranque, el central, donde se encuentra un arco de medio punto con la campana y el remate, sobre el cual se posa una cúpula con linternilla, a la que se le sobrepone una cruz.
La planta del edificio es de una nave, la nave principal cuenta con bóvedas de pañuelo sobre lunetos, la peculiaridad de este templo es que carece de cúpula al centro, la iluminación se obtiene por medio de apertura en los lunetos.
El altar mayor presenta un retablo muy sencillo trabajado en cantera gris, adosado al ábside, donde sobresale al centro un nicho con peana y la imagen de San Francisco de Asís, a los costados columnas pareadas con capitel corintio, sobre estas se posa un entablamento compuesto por un friso y una cornisa, al centro se observa un Cristo crucificado, se enmarca el retablo por medio de un arco de medio punto labrado en cantera.
