El templo de San Hipólito, anexo al hospital del mismo nombre, se originó en la ermita que se levantó para conmemorar a los conquistadores que sucumbieron durante la "Noche Triste"; popularmente se le conoció como templo de los "Mártires".
Don Artemio del Valle Arizpe atribuye su construcción al interés del conquistador Juan Tirado, pero, genéricamente, se considera a Hernán Cortés como su promotor principal, en recuerdo del 13 de agosto de 1521, fecha en que cayó Tenochtitlán y día que el santoral le dedica a San Hipólito.
Según Cédula Real de Carlos V emitida el 22 de julio de 1547 ordena que: "En aquella iglesia en cada año se hiciese conmemoración de las ánimas de los que allí y en la conquista de la tierra habían muerto". La primitiva construcción debió ser de adobe y en 1601 se encontraba en tal mal estado, que los religiosos encargados del hospital adjunto, acondicionaron una sala para las celebraciones religiosas. El nuevo edificio se concluyó en 1739 y se estrenó el 20 de enero de 1777, teniendo el patronazgo del mismo el Ayuntamiento.
De este templo salía la procesión que formaba parte de la ceremonia que se conoció como "El paseo del Pendón", -realizada, para conmemorar la caída de la gran Tenochtitlan-, celebrada el 13 de agosto de cada año desde 1528 hasta su anulación por las Cortes Españolas el 7 de enero de 1812. A mediados del siglo XX fue construida la torre del poniente, en imitación a la del oriente. El templo fue restaurado en épocas recientes, recuperándose el nivel original.
El atrio que precede al templo por el sur, ha sido escalonado en forma descendente para poder comunicarse con el nivel inicial del templo, el cual fue recuperado en su interior, pudiéndose liberar la totalidad de la fachada principal.
El edificio se desarrolla en planta de cruz latina cubierta en el coro por una bóveda con lunetos, en la nave por dos casquetes esféricos, en el crucero por una cúpula octogonal con linternilla sobre tambor, en el ábside por una bóveda de crucería y en los brazos del crucero por medios casquetes esféricos.
En el muro poniente de la nave se encuentra una capilla con la portada por el lado de la nave semirrasurada. En el muro oriente del ábside se localiza una tribuna cubierta por una celosía de madera; en el extremo Nororiente se encuentra la sacristía con una portada interior enmarcada en cantera labrada, con estrías ondulantes en las pilastras y continuas en el cerramiento de platabanda.
La fachada principal, orientada hacia el sur, está conformada por dos torres que delimitan la portada. Ésta se compone de tres cuerpos y un remate.
En el primero se abre al centro un arco de medio punto moldurado, decorado en la piedra clave y las enjutas con relieves; está flanqueado por columnas toscanas y en los intercolumnios se encuentran nichos sobre ménsulas actualmente vacíos. Un entablamento corrido cierra este cuerpo y da el desplante al segundo, en el que un relieve de San Hipólito es el elemento central. Este se encuentra enmarcado por una moldura con acodos y a los costados, pares de pilastras entableradas que en el intercolumnio acogen nichos sobre ménsulas con esculturas religiosas.
Como elemento central del tercer cuerpo se abre una ventana enmracada por pilastras en cuya parte superior se localiza un nicho central que aloja una escultura con la imagen de San José.
Remata la portada un copete conformado por dos escudos de los cuales el inferior, está enmarcado por dos roleos. A los costados del copete se localizan cuatro pináculos.
Los basamentos de las torres, colocados al sesgo, están recubiertos con ajaracas y sobre ellos se levantan dos cuerpos y un cupulín. El primero romboidal al igual que los basamentos, con cuatro arcos trilobulados enmarcados por estípites y el segundo ochavado, con arcos de medio punto y nichos carentes de esculturas.
En la esquina suroriente del atrio, que estuvo delimitado por un muro, se encuentra un monumento en el que se representa en relieve " ... una gran águila que levanta cogido entre sus potentes garras a un indio con su cendal de plumas y airosa garzota y debajo un trofeo formado por arcos, flechas, hondas, macanas, carcaxes y mazas, tamboriles, teponaxtles, flámulas mexicas y otras armas de los antiguos aborígenes, y en la parte superior se ve un leño encendido". Remata todo esto un óvalo con una inscripción en que se lee: "Tal fue la mortandad que en este lugar hicieron los aztecas a los españoles la noche del día primero de julio de 1520 llamado por esto "Noche Triste", que después de haber entrado triunfantes a esta ciudad en el año siguiente resolvieron edificar aquí una ermita que llamaron de los mártires; y la dedicaron a San Hipólito por haber ocurrido la toma de la ciudad el día 13 de agosto en que se celebra este santo. Aquella capilla quedó a cargo del Ayuntamiento de México quien acordó hacer en lugar de ella una iglesia mejor que es la que hoy existe y fue comenzada en 1559".
El monumento fue construido por el arquitecto José Damián Ortíz de Castro. Fue declarado monumento el 9 de febrero de 1931.
