El inmueble consta de atrio, templo, sacristía y anexo: la casa cural que poseía ha sido desagregada con la prolongación de la calle 19 y pasado a manos de particulares: aunque no se tienen datos históricos, la tipología del módulo del presbiterio y sacristía permite suponer que fungió como capilla desde épocas muy tempranas para consolidar su nave probablemente a mediados del siglo XVII.
La siguiente información fue tomada textualmente del Catálogo de Construcciones Religiosas del estado de Yucatán. Editado por la Secretaría de Hacienda y Crédito Público. Dirección General de Bienes Nacionales. Formada por la Comisión de Inventarios de la Cuarta Zona 1929 - 1933. Recopilado por Justino Fernández.
"SAN ISIDRO.
HISTORIA. No se sabe nada relativo a la época de construcción de este templo, más por sus indicaciones arquitectónicas puede suponerse que es del siglo XVI.
DESCRIPCIÓN. El templo de un solo cuerpo, tiene un anexo al lado norte del presbiterio. Tanto el techo del templo como el del anexo es de rollizo.
El del templo en forma de bóveda. A la izquierda de la entrada principal, está el caracol que conduce a los campanarios, que son dos, y al lado derecho está el bautisterio. Empotrado en los muros laterales, hay dos nichos grandes y dos chicos. El piso es de hormigón. En la esquina que forman las calles 16 y 21 existen huellas de la barda que limitaba el terreno dedicado para comercio, así como de una pieza que también ha desaparecido. Al lado norte del atrio existen cinco piezas de las cuales cuatro están en ruinas y una en buen estado, con piso de hormigón, techo de rollizo y paredes de cal.
CONDICIONES MATERIALES. El templo se encuentra en regulares condiciones de conservación y la construcción de los cinco cuartos, salvo uno, están en ruinas."
