La localidad de San José Camotinchán no aparece en relaciones geográficas si no hasta la segunda mitad del siglo XIX en que se menciona que fue elevada al rango de pueblo en enero de 1882, perteneciente a la parroquia de san pedro amuzgo y no se menciona la existencia del templo por lo que es de suponer que los desplantes de muros y montículos de material de núcleo y mampostería, que se observan alrededor del templo moderno, sean parte de una construcción de fines del siglo XIX o principios del siglo XX. Como, los vestigios se encuentran de manera dispersa por lo que su lectura arquitectónica es difícil, al parecer la planta estaba dispuesta de manera distinta sobre un eje norte-sur, con el ábside hacia el sur y el acceso al norte
