El conjunto parroquial de San José se encuentra a un costado de la plaza central del poblado de San José Lachiguri. Este se halla asentado sobre un terreno montañoso en el que se abren pequeños llanos, al extremo oriente de la sierra de Miahuatlán. El sitio fue fundado como una hacienda por don Miguel de la Cueva en 1681, misma que años más tarde sería adquirida por los pobladores del lugar.
El templo de San José tiene una fuerte presencia urbana. Sus componentes espaciales son el atrio, el templo y algunas construcciones secundarias.
El atrio está jardinado, con andadores centrales y una cruz de piedra sobre base cuadrada. Está delimitado por una barda de mediana altura, con una entrada frontal y dos laterales construidas recientemente.
El templo, de una sola nave sobre planta rectangular, está dividido en cuatro entrejes y el presbiterio. La fachada principal, dispuesta al poniente, está compuesta por dos torres laterales que flanquean la portada. de estas cabe decir que fueron dañadas durante los sismos de 1931, sufriendo el derrumbe de sus campanarios originales, por lo que los que ahora tiene fueron reconstruidos algunos años después. Las torres están reforzadas estructuralmente con castillos y trabes de concreto armado.
La portada tiene dos cuerpos y remate. El primer cuerpo está enmarcado por pilastras lisas y tiene la puerta con un arco de medio punto, con pilastras como jambas; en las calles laterales hay dos nichos vacíos, ornamentados con un trabajo de yesería a manera de cortinajes. En el segundo cuerpo se prolongan las jambas hasta flanquear la ventana octogonal del coro. También hay nichos laterales de mayor tamaño con respecto a los de abajo y con la misma ornamentación. El remate está trabajado como un tímpano semicircular, con la inscripción JHS al centro y un vano vertical a cada lado. Los campanarios son de planta cuadrada y tienen un solo cuerpo, con medias muestras estriadas flanqueando los arcos de los campanarios. Tienen también su entablamento y cornisa, coronados con pináculos. Los remates están coronados con pequeños cupulines rectos con una cruz.
Los paramentos laterales del templo no están aplanados y muestran los muros de mampostería a base de sillares de piedra y ladrillo de barro cocido, aparejados en hiladas horizontales, de los que sobresalen los volúmenes alargados de los contrafuertes. Hacia el sur hay varias construcciones de escasa altura que alojan la sacristía y la habitación cural (esta última construida con tabicón y concreto armado).
El ábside es un cuerpo prismático de base cuadrada, con gruesos contrafuertes en el frente y en el muro testero. Su cubierta es una cúpula de gajos con linternilla ciega. Tiene refuerzos de concreto en las aristas. Debe tratarse de una antigua capilla del siglo XVII a la que, durante el siglo XVIII, se le construyó la nave.
El primer entreje de la nave está ocupado parcialmente por el sotocoro y el coro (este tiene una cubierta de cúpula sobre pechinas). El siguiente tramo tiene bóveda de cañón corrido, perforada por una hilera de vanos cuadrados en la parte alta del intradós y por lucernarios sobre las impostas. Existe portada lateral muy sencilla en el tercer entreje del lado norte, con pilastras y un frontón cortado, con un vano abocinado en la parte alta. En los muros laterales del último tramo existen cuatro nichos con altares llenos de imágenes en escultura y pintura de diversos tamaños y estilos.
La ornamentación al interior está hecha con el uso de distintos colores para cada uno de los elementos arquitectónicos. El ábside genera un espacio interior sumamente reducido, con un nivel de piso dos escalones más alto que el de la nave. El altar está presidido por una imagen de Cristo en la cruz.
