El poblado del distrito de Villa Alta está emplazado a 1,900 metros sobre el nivel del mar. Fue fundado en 1530 por familias de Roayaga, Tagui y Yetzecovi, llevando el nombre de Chudela. Una vez convertidos los nobles en caciques en época de la colonia, se le dio el nombre de San Juan en remembranza de la fecha en que se conquistó esa tierra.
El templo de esta población data de 1540. Es de una sola nave y tiene la tipología habitual de los edificios religiosos de la región. No tiene atrio, pues la carretera pasa por el frente; una plaza pequeña hace las veces de atrio. En el costado oriente hay una gran explanada que ahora es cancha deportiva. El templo tiene en su portada dos cuerpos y remate.
El primer cuerpo presenta un vano de acceso cerrado por un arco de medio punto sobre impostas y jambas, todo de tabique de barro. A cada lado hay un par de pilastras sin capitel; un pedestal corrido de lado a lado que apoya las pilastras sirve de banca. El edificio es de una sola nave, sin coro, a la que se le adosan contrafuertes en cada uno de sus lados y en las esquinas. No tiene campanario alguno ni tampoco sacristía adosada.
El inmueble ha sufrido intervenciones muy rigurosas a base de columnas y trabes de concreto empotrados a los muros originales de piedra y tabique; materiales que se muestran en la expresión exterior y con los que fueron construidos todos los muros y contrafuertes del edificio. La techumbre es de lámina, evocando la forma de la techumbre original. No tiene bienes muebles relevantes.
