La construcción del monasterio de Yecapixtla se comienza entre 1535 y 1540 y, al parecer, se termina rápidamente, antes de mediados del siglo. Es la segunda fundación hecha por los agustinos.
El atrio de la iglesia presenta barda almenada. Se conservan en él cuatro capillas posas, construidas en la segunda mitad del siglo XVI. Son estructuras cúbicas rematadas en un pretil y almenas, de las que resaltan las esquinas por su mayor dimensión; el acceso se hace por una doble arcada, encontrándose el altar en el eje que corresponde al camino de las procesiones.
El conjunto tiene aspecto de una fortaleza.
La fachada de la iglesia es abocinada y sigue una línea austera. La portada es de estilo plateresco. El arco de entrada es de medio punto y se apoya sobre jambas, las cuales presentan decoración labrada. La arquivolta se halla profusamente decorada mediante un festón. Adornan las enjutas un angelito en cada una de ellas. La puerta está enmarcada por un par de columnas estriadas a cada lado; a la altura de las impostas se ven interrumpidas por una cornisa. En los intercolumnios se abren dos hornacinas a cada lado. El enmarcamiento de la puerta se halla cerrado por una cornisa, en cuyos extremos se levantan dos floreros. El friso presenta decoración de angelitos. Finalmente, una cornisa da término a todo este conjunto. En el segundo cuerpo de la portada se abre un nicho central y, a los lados, se hallan esculpidos dos escudos. Remata este cuerpo un frontón, cuyo tímpano contiene un Cristo de piedra. A la altura del coro hay un rosetón gótico de tracería.
La fachada se ve coronada por un conjunto de almenas y por un remate en el centro, almenado también. Los dos contrafuertes que abocina la fachada terminan en garitones.
La torre, situada al sur de la iglesia y en segundo plano respecto de la fachada, es sencilla; consta de dos cuerpos y un remate formado por un cupulín.
La capilla abierta, que se fecha desde antes de 1550, está al mismo nivel que el primer piso del convento. Está colocada sobre la portería.
Al lado norte hay otra puerta de acceso a la iglesia, fechada antes de 1540. Su decoración consiste en pilastras con columnillas adosadas, cuyo capitel ostenta decoración de motivos florales. El arco de la puerta es de medio punto sobre jambas y su entablamento contiene dos medallones.
La iglesia es de planta rectangular, con testero poligonal. Es de una sola nave, techada con bóveda de cañón corrido, mientras que el presbiterio está cubierto de bóveda de nervaduras. El sotocoro también tiene este tipo de bóveda, con pintura al fresco. Los confesionarios se encuentran dentro de los muros laterales de la nave. Tanto los altares como el ciprés son de estilo neoclásico. En la nave se conserva un bello púlpito de líneas góticas.
Una puerta con remate ojival conduce del templo al convento. Su claustro es sencillo. Conserva restos de pintura y, en el centro, hay una fuente de piedra.
En 1993 fue colocado un piso de mármol (mate) en el presbiterio y la nave principal. El edificio que ocupa la presidencia municipal pertenece al conjunto conventual. Se encuentran adosados al muro oriente de la nave unos sanitarios, salones de un antiguo plantel escolar y una barda de adobe, que alteran las características arquitectónicas del monumento.
