El conjunto esta compuesto por su atrio de muy buenas dimensiones, el claustro, el templo, el huerto y tierras de siembra. La fachada completa se integra con las ruinas de la capilla del rosario, la portada del templo y la porteria del claustro.
La fachada de la iglesia, de planta poligonal, se forma con muro liso con la puerta principal en arco de medio punto enmarcada con un alfiz sin decoración. En seguida se abre la ventana de coro también con arco de medio punto formado por dovelas y sobre ella un nicho enmarcado por pilastras y dentro de este una escultura de bulto. Finalmente, el remate de la fachada es de forma mixtilínea.
Sobre el lado izquierdo de la fachada se levanta la base y torre del campanario con dos cuerpos de estilo barroco: el primero con arcos enmarcados por pilastras, columnas salomonicas y columnillas rematadas por un conjunto de tres almenas en cada esquina
El segundo cuerpo, de menores dimensiones, presenta pilastras, molduras y la caratula de reloj en cada lado y coronamiento con cupulín y un carrillon.
Sobre el muro lateral izquierdo (norte) sobresalen los pesados contrafuertes del muro en forma de remo, que recibe los esfuerzos de la bóveda de cubierta de la nave.
La planta es rectangular, de gran dimensión, cubierta en cuatro tramos con bóveda de arista y la estructura de coro y sotocoro del mismo tipo.
En el interior, las decoraciones de los altares mayor y laterales son de estilo neoclásico.
Al lado sur de la iglesia (derecho) esta el convento. El claustro en su planta baja tiene vanos con arcos de medio punto sostenidos por gruesas bases. En los cuartos de la planta alta ya modificados por el deterioro aun se encuentran restos de interesante pintura mural, lineal y decorativa, ejemplos valiosos del arte del siglo XVI.
San Juan Bautista fue, originalmente, curato secular hasta que en 1562
fue dado a los padres dominicos, posteriormente fray Juan de la Cruz construyo el convento, terminandolo en el año de 1581. El largo abandono dejo huellas en los muros del edificio, la capilla del rosario destruida, la huerta mutilada y la pérdida de tierras de siembra; hasta que a principios del siglo XIX, cuando se colapso parte del templo, tuvo que ser reconstruido. Durante los ultimos años, la huerta volvio a ser mutilada durante el mandato del gobernador Lauro Ortega, debido a la ampliación del mercado municipal.
