La parroquia data del siglo XVI y fue construida por la orden de San Francisco, aunque el edificio que hoy vemos muestra serias modificaciones. Existen confusiones por su ubicación.
En 1921, el reporte del jefe de Hacienda indica que se ubicaba de la siguiente manera: “...En la plaza principal... EXTENSIÓN: 160 m²... LINDEROS: Oriente: calle...; Norte: propiedades...; Poniente: calle...; Sur: plaza principal...”.
En 1934, el jefe de Tenencia reporta fuertes daños al edificio. Su informe dice: “...Debido a los temblores de estos dos últimos años, sufrieron mucho los muros, resultando algunas grietas. Se ha procurado resarcir los desperfectos sin que nada se cambie en el aspecto sustancial del edificio.
El templo se encuentra abierto al culto público de los fieles, quienes tienen libre acceso por sus actos de piedad. Los encargados de su custodia son el presbiterio y los diez vecinos de la Junta Vecinal...”. En el inventario que se anexa se incluye: una custodia, un copón y un cáliz, además de las imágenes de talla de San Juan, San José, dos Cristos y la Purísima, además de varios cuadros y tres campanas.
El edificio sufrió algunas invasiones en 1955, propiciadas por Hacienda y la Comisión de la Cuenca del Tepalcatepec. Esta última pretendió hacer una cancha con baños y lavaderos. “...Una vez empezada [la cancha], el señor cura intervino alegando que estos terrenos pertenecen al clero y al gobierno, agitando a la gente a que destruyeran el campo deportivo y mejor hicieran una casa cural... Los deportistas sacaron sus tableros para que no hubiera derramamiento de sangre; los del bando del señor cura hicieron los vallados grandes y acarrearon piedra... y siguen acarreando...”. En 1955, Bienes Nacionales autorizó construir el curato y Hacienda insiste en el uso del terreno con un escrito que daba un ultimátum en los siguientes términos: “...Si en el atrio del templo de Pamatácuaro, Mich., no se construye la casa cural que se autorizó por esta Dirección, esa Federal de Hacienda debe impedir que se dé otro uso distinto al inmueble...”. En respuesta, ese mismo año se dice que la obra es el curato y que ya están casi todos los cimientos.
En 1970 se solicitaban sus dimensiones con base en el artículo 2.º de la Ley de Nacionalización de Bienes Reglamentaria de la fracción II del artículo 27 constitucional.
La demolición del curato se extendió a la iglesia y los vecinos terminaron por destruirla para edificar un templo nuevo, cuyas características “de modernismo” dejan mucho que desear. Como único vestigio de su antigüedad, se conserva el terreno del atrio, con parte de la antigua barda delimitándolo, y en su centro, sobre un triple escalonamiento de piedra, se desplanta un basamento cuadrado sobre el que se ubica la cruz atrial con su peana piramidal.
