El templo de San Miguel se conoce como la misión de San Miguel Zapotitlán, construido por los Jesuitas en el año de 1606. de la edificación original solo queda la cimentación y parte de algunos muros como el bautisterio, por lo que ha perdido parte de su valor histórico en lo arquitectónico, aunque no tanto en las tradiciones y costumbres de la población ya que conserva su importancia como centro de reunión y ceremonias sobre todo en cuaresma y semana santa cuando se observa gran afluencia de fieles de fieles que bajan de las comunidades de los altos a celebrar las festividades religiosas con sus atuendos típicos.
