Se trata de un conjunto formado por cuatro construcciones de diferentes épocas que, con las modificaciones, se han integrado como una sola dentro del amplio y arbolado atrio. En primer lugar, está la original de San Miguel Arcángel, correspondiente al siglo XVI y que forma parte del templo actual; la capilla de Guadalupe, de un agradable barroco popular del siglo XVIII, ubicada en un patio interior al lado derecho de la nave principal y que actualmente se encuentra en total estado de abandono; la ampliación a la capilla original hecha en el siglo XIX; y la nueva construcción de anexos y arcos de acceso en el exterior de la nave principal. Actualmente se encuentra en proceso de reconstrucción el doble arco de acceso que se destruyó durante el sismo de 1985.
El ingreso atrial principal está por el costado izquierdo de la nave, a la que se entra por tres verticales arcos de medio punto flanqueados por columnas redondas a base de piedra labrada, con basamento, fuste liso y capitel moldurado. Esta fachada lateral sería, por su ubicación, la portada principal del templo. El original ingreso principal, sobre el lado poniente de la nave, es a través de un arco de medio punto con las mismas características.
Sobre el costado izquierdo de la nave, al fondo, se encuentra la remodelada torre del campanario y algunos anexos que funcionan como sacristía y casa parroquial, todo ello con características de construcción moderna y de poca importancia arquitectónica. Sobresale en la cubierta de la nave otra torre de construcción reciente que aloja una carátula de reloj.
La planta del templo es de forma irregular debido a las diferentes modificaciones que se le han hecho al inmueble, pero pretende ser una pequeña cruz latina correspondiente a la planta de la antigua capilla integrada a la gran nave principal de construcción posterior.
En el interior, la decoración es de características sobrias, solo interrumpidas por algunos elementos de estilo neoclásico que se han conservado, como el púlpito, los nichos y el modesto retablo de la capilla lateral derecha. En el altar mayor, sobre el ábside plano, se encuentra también un sencillo ciprés de estilo neoclásico; el área de coro y sotocoro se integra mediante una estructura de bóveda vaída. Aunque se encuentra en estado de abandono y con el riesgo de colapsarse, es de interés describir brevemente la capilla de Guadalupe, de estilo barroco. La fachada se compone de tres tableros y una espadaña mixtilínea como remate.
Al lado derecho se encuentra parte de la esbelta torre del campanario, dañada por el sismo de 1985. La planta es en forma de cruz latina, cubierta con bóveda de cañón, al parecer soportada por arcos interiores, y en el transepto se levanta una cúpula de tambor y forma poligonal, con linternilla y cupulín.
Xoxutla era uno de los pueblos sujetos a Cuernavaca a la llegada de los españoles. Sometidos a Hernán Cortés, los franciscanos establecieron allí la visita de San Miguel, que atendían más tarde desde el monasterio de Tlaquiltenango. En el siglo XVIII, durante el auge surgido por las haciendas azucareras, fue construida la capilla gremial de Guadalupe, con un barroco popular agradable. En el siglo XIX se inició la ampliación de la antigua capilla de San Miguel Arcángel, construyendo al frente una nave de grandes proporciones. Actualmente se cuenta con proyecto arquitectónico de modificaciones del inmueble, que refleja el auge económico que ha adquirido el lugar como centro regional.
