Ubicada la capilla dentro de un atrio pequeño, en donde predomina la sencillez de su fachada.
La portada está formada por un arco de medio punto que da acceso al interior del inmueble, soportado por jambas e impostas. Sus enjutas son lisas, marcadas por dos pilastras y una cornisa de enmarcamiento, sobre la que se encuentra una pequeña ventana circular. El remate de la fachada es a partir de una moldura horizontal con almenas trapezoidales, sobre la que se levanta una sencilla espadaña de dos cuerpos que contiene tres ventanas con arco de medio punto en su parte inferior y una más en la superficie, que termina en forma piramidal, y una almena en cada lado de su base.
Al lado derecho de la fachada, la torre de dos cuerpos, de planta rectangular y vanos con arco de medio punto en cada cara; el primero, con molduras romboidales en bajorrelieve como decoración y cornisa de cierre para iniciar el segundo, de menores proporciones y que posee los mismos elementos, con excepción de la cornisa, que tiene dentellones en todo su perímetro. Se remata con el cupulín de forma piramidal y la almena que sostiene la cruz.
La planta de la nave es rectangular, techada con bóveda de cañón corrido y ábside plano. La sacristía, adosada sobre el costado derecho, también es rectangular y está techada con bóveda de cañón.
Los conflictos surgidos por la separación de los pueblos de Atlatlauhcan y Tlayacapan de la cabecera Totolapan debieron repercutir en el abandono de numerosas construcciones de este tipo. San Nicolás aparece hasta el siglo XVIII como un asentamiento independiente. El inmueble nos muestra la imagen de una portada sobria, rematada por la espadaña en uso durante el siglo XVI. La torre se añadió posteriormente, a fines del siglo XVIII.
Nota: no fue posible tomar fotografías del interior porque solo abren ocasionalmente en días sábados por motivo de celebración. El descuido del inmueble se puede apreciar con las fotos tomadas en el exterior del informal atrio.
