El Templo de Santa María Ndyuaco tiene planta de tres naves, con dos capillas laterales y sacristía. Está construido con gruesos muros de mampostería y cubierto con techumbre de viguería, apoyada sobre columnas de madera en la nave central; el presbiterio tiene una bóveda de pañuelo, apoyada sobre muros más altos que la nave.
El arco triunfal que enmarca el presbiterio está dorado y policromado.
Conserva fragmentos de cuatro retablos de los siglos XVII y XVIII y una pintura al óleo. El retablo del altar principal es de estilo neoclásico y aloja seis esculturas estofadas que posiblemente pertenecieron a un retablo.
Dos torres campanario flanquean la portada de paños lisos, que contiene únicamente el acceso de arco rebajado y la ventana coral de forma circular; en la parte superior tiene un triángulo y remata todo el frontis una fina cornisa mixtilínea.
