En la jurisdicción de Villa Alta de San Ildefonso, en el noreste del estado de Oaxaca, en 1520 vivían indígenas hablantes de cuatro lenguas diferentes y estaba dividido políticamente en veintiocho poblaciones, una de ellas Lalopa.
Como resultado de las congregaciones de 1600, la sede doctrinal de Guaspaltepec fue trasladada a Chacaltianguisco, y un sacerdote secular fue a vivir a Santiago Lalopa.
Su templo del siglo XVIII está construido en una sola nave cubierta a dos aguas de lámina acanalada y remata contra el frontis de mampostería aparente de la fachada principal. Dos torres campanario flanquean la portada de acceso.
