La población de Atapan fue congregada por los frailes de la orden de San Francisco en el siglo XVI, cuyos miembros fundaron un edificio religioso que aún conserva parte de sus características originales, las cuales se evidencian en la magnífica volumetría de la portada principal.
Durante la regularización de Bienes Nacionalizados, el edificio sufrió agresiones similares a las de todos los de su género. La inspección de Hacienda de septiembre de 1921, en el expediente 174, dice: “En la plaza principal del pueblo de Atapan, dos mil metros cuadrados. Por el oriente, calle en medio; por el norte, calle en medio; por el poniente, calle en medio; y por el sur, con Vicente Ruíz...”. Un año después, el 9 de febrero de 1922, el informe del presidente municipal agrega: “2000 m², 5000.00 valor...”. En ese entonces, a decir de los informantes, el templo parroquial se encontraba anexo a la casa cural y tenía un valor estimativo de 2000.00, incluyendo anexidades.
En el año de 1936, el inspector de Educación Federal del E
