El pueblo de Santo Domingo Ixcatlán fue una cabecera subordinada a Yolotepec en el siglo XVI, en el que se hablaba el mixteco.
El templo que se conserva hasta nuestros días es de una nave, separada en tres tramos cubiertos con dos cúpulas de media naranja sobre basamento octagonal y una de pañuelo; el presbiterio está cubierto con bóveda de cañón con lunetos, y sus muros exteriores rematados con crestería mixtilínea.
En su interior se conserva un retablo barroco con 13 óleos y 2 esculturas, desarrollado en tres cuerpos, separados en cinco calles por columnillas estípite.
Su portada se concentra en el enmarcamiento del acceso de arco trilobulado, flanqueado por medias muestras que sostienen un entablamento y continúan al segundo cuerpo, cambiando su sección semicircular por la de pilastras, y al centro la ventana coral de forma octagonal con derrame. En la parte superior, el entablamento tiene el frontispicio rematado por un angosto ático con nicho sin escultura al centro.
Dos pesados basamentos flanquean la portada, pero ninguno de ellos tiene campanario.
