Situada en un área muy escarpada en la Sierra Madre y el Nudo Mixteco, Santo Domingo de Yodohino fue una población prehispánica que sobrevivió como pueblo.
Los dominicos evangelizaron esta área, pero el 1.º de febrero de 1743 el rey firmó una cédula real por la que se expropiaban a los dominicos todas las casas vicarias, para que fueran entregadas a los clérigos.
Recurrieron al rey y este concedió, el 23 de junio de 1757, que quedase en poder de esta provincia el convento y curato de Teposcolula, y la vicaría y curato de Coixtlahuaca, desde los que atendían treinta pueblos.
La planta es de una nave reforzada con contrafuertes dispuestos rítmicamente a lo largo de sus muros, y uno de mayores dimensiones en el muro testero.
La portada es de estilo renacentista y se reduce a la decoración del acceso de medio punto, con enmarcamiento de cantera con casetones con el símbolo de la cruz foliada inscrita al centro y Santo Domingo en la clave. Dos cornisas limitan en altura la ventana coral y, en la parte superior, un nicho con escultura. Todo el frontispicio tiene un remate de líneas curvas, con pináculo al centro.
Contiene una inscripción: “1709 año hmm a miercol 30 ener”.
Tiene una sola torre y está integrada al paramento de la portada. El campanario es de un cuerpo de planta cuadrangular y remate con cupulín de base ochavada.
