La fachada barroca del templo de Santo Tomas hace una bella combinación con la vegtación de su pequeño atrio.
La fachada, integrada por la torre, la portada de tres cuerpos y la espadaña con su basamento en el lado derecho, le dan un agradable sentido de esbeltez al inmueble.
La portada se inicia con el esbelto acceso con un arco de medio punto flanqueada por dos pares de pilastras curvilíneas con basamento y capitel. En el segundo tablero se repite el tema inferior pero de menor altura y con un nicho de forma rectangular en el centro. El remate es un frontón curvilíneo con molduras de adorno.
La torre con su basamento es de dos cuerpos y columna con pináculos adosadas en las esquinas y vanos de medio punto en cada cara; el segundo cuerpo es de base ochavada sin vanos y con mmolduras en la parte superior, el remate es un capulín de forma circular con la cruz sobre una semiesfera.
Del lado derecho se levanta el basamento y la espadaña semicircular de una ventana, adornada con pilastras interiores adosadas a los muros.
La planta es rectangular, cubierta con bóvedas de arista y de cañón en área de coro, soportadas por columnas interiores adosadas a los muros.
En el inetrior, el altar mayor y los laterales son de estilo barroco al igual que las esculturas o frenados por la piedad barroca. Adosadas a los gruesos muros hay nichos con esculturas de bulto.
Sobre ambos costados se levanta gruesos contrafuertes y la sacristia, cubierta con bóveda de cañón corrido, en la parte posterior del lado izquierdo.
En el iglo XVI, Popotlan era un pequeño asentamiento a la orilla del rio Amatzinac. Atenido posteriormente por los agustinos que permanecieron ahí hasta finales del siglo en que iniciaron la fundación del templo, dedicdo a Santo Tomas.
