La cúpula original de este templo era un elemento de estilo barroco, de planta octagonal con arbotantes. Se desplomó en 1808 cuando se quiso modificar el aspecto de los pilares en el interior del crucero. Esta cúpula fue construida mucho tiempo después, de 1868 a 1884 por el maestro de obras Herculano Ramírez sobre un diseño del Arq. Vicente Heredia.
