En algunos sitios conserva parte de la policromía original, a base de pigmentos a la cal. Se aprecian algunos tonos de amarillos y rojos. Fue parcialmente restaurada en 1997 por Guanajuato Patrimonio de la Humanidad, AC, quien realizó trabajos de limpieza y consolidación al tiempo que colocó la malla antiaves que la protege de la contaminación por excrecencias.
