La capilla de Ibarra se ubica en un cerrillo de prehispánicos, ya que este sitio fue el puerto de Aterio (lugar de chirimoyas), donde los sobrinos de Tariácuri tomaron prisioneros a algunos espías durante sus luchas de conquista. El mismo rey Tariácuri ordenó asentar a los de la isla Cuyumeo en este lugar, construyendo allí sus cúes. Fue un importante puerto tarasco hacia los pueblos de la laguna.
El presbítero Zavala indica que, en el lugar, los españoles edificaron una capilla dedicada a San Pedro y San Pablo, donde se dio la primera misa. El islote que se encuentra enfrente se llamó de San Pedrito por la influencia de la capilla.
El ilustre benefactor patzcuarense tuvo este sitio como parte de su hacienda, construyendo cerca de ella su casa durante el siglo XVIII. El lugar conservó su nombre, ya que fue un personaje apreciado por sus donativos a obras pías de la ciudad.
Los peones de la hacienda construyeron sus viviendas en terrenos de la finca, fundándose así el actual caserío, que se repobló con la regularización agraria de principios de siglo, desapareciendo en 1936 la hacienda y su capilla. La lejanía hacia Pátzcuaro propició que los vecinos, apoyados por el entonces abad don Rafael Méndez, en terrenos donados por doña María Salud Alcántar y su esposo, el señor Martín Ramos, emprendieran la construcción de una nueva iglesia.
La obra se inició en 1941 con donativos de los vecinos, quienes construyeron la iglesia similar a la que ya existía, con un altar basado en la fotografía que trajo el padre Ortega del existente en el templo de la Cruz.
El nuevo templo se inauguró en 1944 con la bendición del arzobispo de Michoacán, don Luis María Altamirano y Bulnes, y del abad y párroco don Salvador Carranza.
En 1964 pasó de ser capellanía a parroquia.
Durante los años siguientes, se siguió enriqueciendo el edificio con donativos de imágenes de relevancia artística e histórica.
