Ubicada al sur de la cabecera distrital, Santa María Zacatepec constituye una de las poblaciones en la ruta hacia el litoral del Pacífico.
Dos masivas torres campanarios enmarcan la portada principal del nuevo templo; del antiguo no quedan vestigios.
A la llegada de los españoles, la mayor parte de la región, si no toda, estaba sometida por el señor de Tototépec. Existían una serie de comunidades que, aunque sujetas directamente a Tototépec y tributarias suyas, parecen haber conservado cierto grado de autonomía política, con señores hereditarios, gobernadores o recaudadores de impuestos. Entre ellas estaba Zacatepec (Yucuchatuta), asentamiento fronterizo enfrentado a la guarnición de Poctla. En Amuchco y Zacatepec se hablaba amuzgo (dialecto mixteco).
Zacatepec fue encomendado al conquistador Rafael de Trejo y heredado (antes de 1548) por su hijo Rafael de Trejo Carvajal, quien aún vivía en 1604.
Santa María Zacatepec tenía doce estancias en 1548, reunidas en la cabecera hacia 1600.
