El Santuario de Guadalupe, o templo de San Diego, sirve como remate a la calzada fray Antonio de San Miguel y es uno de los lugares que mejor conservan su tipicidad en la ciudad de Morelia.
Se inició en 1708 y se terminó en 1716. de 1729 a 1737, el obispo Escalona y Calatayud edificó al lado norte una casa de ejercicios que serviría de retiro a los obispos antes de iniciar sus funciones en la diócesis; para su fácil acceso, ordenó la construcción de la que hoy conocemos como calzada de fray Juan de San Miguel, llamada así por el fraile que la construyó.
Diez años después, los franciscanos descalzos de la rama de San Pedro de Alcántara decidieron asentarse en Morelia.
Considerando la humildad de los miembros de la orden, el cabildo eclesiástico, el deán, el ayuntamiento y el obispo aceptaron donarles terreno del clero anexo al santuario para facilitar sus funciones como confesores de las monjas de Santa Catalina y de las novicias de las Rosas.
El apoyo económico para la construcción provino de don Pedro Carriedo, rico vecino que fincó la casa.
En 1760, por cédula real, se autorizó el convento y, en 1761, el virrey marqués de Cruillas dio el pase correspondiente. En 1769 se concluyó la obra por el maestro Diego Durán; sin embargo, el edificio se amplió con el crucero y el presbiterio. El altar se construiría poco antes de la gesta revolucionaria por el arquitecto don Nicolás Luna.
En 1778, Pío VI concede las indulgencias y prebendas de la matriz San Juan de Letrán, en Roma, al convento de Nuestra Señora de Guadalupe, para cuya celebración se colocó una placa en el sotocoro de la nave.
Durante la exclaustración, los dieguinos fueron expulsados, cediéndose el edificio al gobierno, quien lo dejó sin ocupar, por lo que pasó a manos del clero secular. En 1869, el gobierno lo retomó y, cuatro años después, lo cedió como escuela de artes, que no prosperó, inaugurándose en él la primera exposición agrícola, industrial y artística de Michoacán en el año de 1877.
El uso cambió constantemente: fue hospital, hospicio, internado y, por último, escuela de derecho, mismo al que actualmente se le tiene destinado.
El templo se convirtió, a raíz de la decoración hecha por Joaquín Orta Menchaca, inaugurada en 1915, en el más solicitado de Morelia para los eventos sociales. El atrio desapareció en 1859 para convertirse en calle y en plaza, colocándose en la misma una escultura de don José Ma. Morelos.
El fuerte auge económico del templo, actualmente en manos de los franciscanos, ha propiciado su constante renovación, lo que ha repercutido de manera negativa en los bienes muebles, ya que muchas imágenes han sido alteradas de manera irreversible con encarnaduras, repintes, empestañados, etc., haciendo que pierdan gran parte de su interés artístico.
La iglesia, colocada de oriente a poniente, conserva al sur el convento dieguino, remodelado en el siglo XIX, y al norte restos de la casa de ejercicios, tan modificada que tiene aspecto de mimetización urbana, muy lejano a la monumentalidad del conjunto.
La fachada, de gran sobriedad, hecha en pañería, remata en frontón piramidal peraltado en el cual está un nicho que alberga a la Virgen de Guadalupe en medio de un rectángulo con lacerías y una cruz labrada con tres clavos. El remate central es un pináculo esférico. Al centro se concentra la portada, con acceso de medio punto flanqueada por columnas toscanas estriadas sobre base entablerada, que soportan un triple tablero moldurado en el que desplanta la ventana del coro de medio punto, con pilastras laterales acanaladas que cargan un tablero liso enmarcado por dobles molduras.
Al lado norte está la torre de tres cuerpos: el inferior, liso, separado del segundo por doble cornisa. En este último se abren vanos dobles de medio punto en cada una de sus caras; una balaustrada divide al tercer cuerpo de vanos piramidales, remarcando su planta octagonal. Doble tablero, separado por cornisas en saledizo, carga el cupulín gallonado del que salen molduras curvas y que se unen en la cúspide para servir de base a la cruz de remate.
Sobre el crucero se levanta la cúpula, también octagonal, con tambor peraltado y con ventanas alargadas en cada una de sus caras. Los gajos están separados por nervaduras de cantera que arrancan de almenas tipo ánforas, que rematan en una linternilla cubierta con media naranja y una cruz en su cumbrera.
La nave, de planta de cruz latina con cúpula en el crucero, está techada con bóvedas de arista. La cúpula es de tambor circular, desplantado sobre pechinas formadas por arcos torales con pilastras. Las ventanas del lado sur están tapiadas.
El interior es excepcional: la decoración vegetal concebida por Orta difiere de todo lo conocido en la historia del arte religioso; grecas de barro y estuco policromadas, decoradas con flores de origen popular, mezclan todas las corrientes artísticas readoptadas por el porfiriato: el ecléctico afrancesado, los pinjantes moriscos y el art nouveau, mezclados en un barroco aterrado por el vacío, creando un vergel de gran colorido.
Los muros se cubrieron por enormes pinturas referentes a los franciscanos evangelizadores; en los cruceros hay sencillos altares neoclásicos que contrastan con la nave.
