El edificio se ubica en una ladera del rancho. Su construcción comenzó en 1791.
El templo se dispone en un eje surponiente-nororiente, con planta de una sola nave. Presenta características formales muy particulares, ya que es completamente sobrio en el aspecto ornamental. Posee puerta de acceso y presenta torre campanario de un solo cuerpo, anexa al conjunto. La fábrica de los muros es de mampostería de piedra de la región, con aplanado. La cubierta se resuelve a base de armaduras de alma abierta, hechas con madera de nogal.
Fundada en 1791, la Misión de San José de las Palmas, hoy Rancho de San José del Verde, fue evangelizada inicialmente por los misioneros franciscanos del Colegio Apostólico de Propaganda Fide de San Diego del Real de Pachuca, por los frailes José Mariano Bisuete, Pedro Lumbreras, Miguel Ferrando y Francisco López. Más tarde, el fraile José Crespo continuó la comprometida labor evangelizadora durante 33 años.
