La disposición del templo es muy sencilla, de una sola nave. Sus siete tramos conservan solamente los muros y los contrafuertes de la estructura original, ya que tanto el entrepiso del coro como la cubierta de la nave son de construcción reciente.
Las fachadas principal y lateral se articulan en la esquina de la única torre.
La portada principal data de 1889, según dato obtenido de un medallón al centro. Más arriba de la misma hay otra inscripción con la fecha de 1650, que posiblemente formaba parte de la portada original. Su diseño es neoclásico; las jambas del vano central se prolongan en el arco develado, en cuyo centro se destaca una clave pinjante en forma de roleo. Dos pilastras toscanas soportan el entablamento y dejan, entre este y el arco, enjutas decoradas con motivos vegetales.
La portada lateral es más antigua; consta de elementos parecidos a los de la portada principal en el primer cuerpo, solo que carece de entablamento.
El origen del templo de San Juan de Dios data de la llegada de las fuerzas de Hernán Cortés a Oaxaca en 1521, con su primer sacerdote, Juan Díaz, y el capellán del ejército, fray Bartolomé de Olmedo. Ellos fundaron el primer templo que hubo en Antequera, en la antigua plaza del Marqués del Valle. Se trató en principio de una ermita de adobe y paja dedicada a Santa Catalina. En una habitación anexa a la iglesia, Juan Díaz acogió a los primeros dominicos llegados a la ciudad: fray Gonzalo Lucero y fray Bernardino de Tapia. A la llegada del primer obispo de Oaxaca, Juan López de Zárate, fue construida con ladrillo y teja para sus nuevas funciones de sede diocesana. Pero, al concluirse la obra de la primera catedral formal, poco a poco fue abandonada y finalmente fue destruida por el temblor de 1662.
La orden hospitalaria fundada por San Juan de Dios en 1538 en Granada había enviado en 1604 algunos frailes a Nueva España, encabezados por fray Jerónimo de Segura.
Los monjes juaninos llegaron a Oaxaca hacia 1698. Pidieron autorización para la construcción del templo al cabildo y solicitaron la donación por parte del cura de Jalatlaco, a quienes pertenecía originalmente la ermita y excatedral abandonada.
DESCRIPCIÓN de LAS PORTADAS:
Portada principal (poniente):
Se desarrolla en un solo cuerpo; se dispone a partir del vano que ocupa la puerta de acceso, en el cual existe un pequeño peralte que cambia el nivel entre la banqueta pública y el pavimento del umbral de la nave. En la parte inferior se localizan unas basas que le dan sustento a las jambas, las cuales presentan una canaladura que termina en el ástragalo, en la línea de imposta, para continuar con el arranque del arco de medio punto construido con dovelas, y en el centro aparece una clave pinjante que tiene la forma de roleo.
Adelantándose una pequeña dimensión, comienza el basamento de dos pilastras toscanas con canaladura en su perímetro, que termina en el capitel, el cual soporta al entablamento, dando origen a las enjutas, las cuales están decoradas con motivos vegetales.
Presenta el entablamento una arquitrabe de dos franjas y, en el friso, a partir del eje de la pilastra, comienzan los triglifos alternando con las metopas, y abajo aparecen las gotas. En el friso, una leyenda: “SOLD O HONOR ETG LORA”, y al centro una cartela que forma un medallón con la fecha de 1889, justo arriba de la clave, que abarca hasta este elemento.
Un elemento arquitectónico más corresponde a la cornisa, la cual en los extremos se transforma en un frontón quebrado; al finalizar el muro del lado izquierdo, la palabra “año”, y en el otro extremo, al mismo nivel, la fecha de 1650. Este elemento le da soporte a la ventana que ilumina la parte del coro; este vano, de forma rectangular, sin ningún elemento ornamental, termina la portada con el perfil quebrado del imafronte.
Portada lateral (norte):
Su composición se inicia con el vano de la puerta de acceso, en donde sus jambas se prolongan hacia el arco dovelado de medio punto, muy parecido a la portada principal.
Carece de entablamento; aparece un frontón quebrado, el cual lleva un rico decorado con relieves en donde se hace notar el símbolo de los testigos de la pasión, como son el sol, la luna y estrellas.
Una pequeña escultura que representa a Santa Catalina; se aprecian los monogramas de Jesús y María y, arriba, un nicho con una escultura de un arcángel.
Las dos portadas de este inmueble se fabricaron en piedra de cantera de la región, que caracteriza a la ciudad de la Verde Antequera de Oaxaca.
