El origen de este asentamiento, inmerso en el distrito de Villa Alta, se remonta a la época precolombina y, aunque se desconoce la fecha con precisión, se recuerda al jefe Titapax como el que fundó esta población llamada Noolaa, Tetepec o Quichaltepec, nombre que fue cambiado seguramente con la llegada de españoles a estas tierras.
El municipio de Yaganiza se sitúa en la vertiente de un cerro, en un terreno plano al noreste de la ciudad de Oaxaca y al sur de la cabecera del distrito de Villa Alta, al cual pertenece.
El templo, construido en piedra, es de una sola nave, dividido en cinco tramos y el presbiterio. El primer tramo lo ocupa el coro: una losa de concreto armado empotrada en los muros y con una trabe apoyada sobre dos columnas. La nave del templo tiene una cubierta de concreto construida en 1984; se trata de un cañón corrido de medio punto, con arcos fajones sobre pilastras a intervalos semejantes. La bóveda del presbiterio es de 1960; es una cúpula gallonada de base octagonal, peraltada sobre un tambor en el que se ubican cuatro ventanas con vitrales.
A un costado del presbiterio se construyó una pequeña sacristía, con fecha probablemente posterior a la edificación del templo, pero con materiales y manufactura muy semejantes. Por el otro costado, a la altura del tercer tramo y entre dos contrafuertes, se abre un acceso lateral al templo.
