La existencia de esta capilla se consigna en las crónicas del siglo XVI, cuando los cronistas de Huango nos dicen que esta población, fundada y favorecida por el famoso encomendero don Juan de Villaseñor, tenía como barrio a Puruándiro y que este, a su vez, comprendía los barrios de Tzimbanguaro, Conguripo y Santa Ana (hoy Isaac Arriaga), doctrina a cargo de don Pedro de Texeda.
Poco sabemos de su historia, pero subsistía como centro agrícola relevante a principios de este siglo, en el que formó parte del conflicto agrario, habiendo sido escenario de luchas entre agraristas y fraccioneros en el año de 1933, luchas que continuaban en 1939, cuando los fraccioneros, favorecidos por los dueños de las haciendas, atacaron a los de Puruándiro, quedando un saldo considerable de muertos y heridos.
El reparto de tierras propició la redensificación del sitio, que en 1980 tenía “... elevado índice demográfico; Centro de Salud... hospital con 12 camas... calles alineadas y empedradas, casas de ladrillo o de adobe... terrenos de riego...”. Ese mismo año, por decreto de don Mariano Jiménez, se creó la Tenencia de Huipana, que comprendió, entre otros, el Rancho de Santa Ana, hoy Isaac Arriaga.
La monografía publicada en esa fecha dice: “... En Isaac Arriaga el vecindario está puesto a la faena y entrega sus aportaciones en efectivo... ya que actualmente llevan a cabo la ampliación del Templo de Santa Anita, que era de adobe y techo de duela. La nueva fábrica es de ladrillo; a la entrada se ubica una pila de cantera y en el altar mayor están las imágenes de Santa Ana y la Virgen Niña, a la que se llama Santa Anita. de ahí el nombre del templo...”.
La capilla actual se ubica anexa a lo que fue el casco de la hacienda, como en un principio. Consta de nave, torre y un reducido atrio.
La fachada es lisa y se observa inconclusa en el imafronte y en los elementos que conforman la portada, compuesta esta última por un arco de medio punto con extradós moldurado que descansa sobre pilastras toscanas entableradas, carentes de basa, que se flanquean por otras pilastras acanaladas con fuste similar, ornamentadas en el friso por una flor en el centro. El entablamento moldurado de cornisa volada carece de decoración. En el extremo izquierdo de la portada se encuentra una pilastra más, de fuste liso, que se recorta, carente de remate; el imafronte es curvo, sin remate superior.
La torre es cuadrada, de un solo cuerpo, con vano rectangular lateral y remate de chapitel piramidal; es de mampostería lisa y recubierta de aplanado con pintura a la cal.
La nave es de planta rectangular, con ábside plano. Es probable que haya sido prolongada hacia la parte posterior, substituyéndose gran parte de los originales muros de adobe, reforzándose por el exterior con muros de tabique. Nos cuesta creer que la fotografía de archivo que sacamos de la Monografía de Puruándiro se refiera al mismo templo. En ella vemos los muros de adobe agrietados de respaldo a un altar sencillo de columnas jónicas que alberga la imagen de Santa Ana y la Virgen Niña; la cubierta es de duela, con decoración simulando una bóveda de arista a base de guías floridas que convergen en un amplio rosetón.
El edificio actual tiene cubierta de cañón corrido, una ventana de iluminación, a excepción de un óculo mixtilíneo que ocupa la parte central del ábside, en el cual no se encuentran vestigios del altar. Los muros están pintados en azul y verde, llenos de manchas y chorreamientos, con un rodapié negro de pésimo gusto. El piso de terrado conserva dos sillas de paleta desarmadas que denotan un nuevo uso como escuela. No encontramos vestigios de las imágenes que vemos en la fotografía de los años setenta.
