Santa María Natividad Chalcaltongo (Ñundeya) tenía a fines del siglo XVI ocho estancias, la mita de ellas cerca de la cabecera en partes altas y la mitad al sur en tierra caliente.
El templo actual data del siglo XVIII, es de cruz latina y está cubierto con bóvedas de cañón con lunetos. Dos cúpulas semiesféricas cubren el crucero y el tramo anterior a éste.
Conserva en su interior dos pequeños retablos de madera dorada, de estilo barroco.
La portada principal es de dos cuerpos con remate y está flanqueada por dos torres con campanario de dos cuerpos, construidos en el siglo XIX.