En la Relación geográfica e histórica de la Nueva España, de Peter Gerhard, se asienta que las Amilpas fueron visitadas desde Guastepec hasta que los dominicos construyeron una casa en Santiago Cuautla en la década de 1580. La actual parroquia de Santiago fue dedicada originalmente a Santo Domingo y, en su portada, se lee la fecha de 1635. Está resuelta en una nave separada en tramos, cubiertos con bóvedas de cañón con lunetos, sacristía, capillas laterales y dos torres campanario.
