La comunidad de Santiago Zacatepec se encuentra al noreste de la ciudad de Oaxaca; es cabecera municipal y cabecera distrital, cuyos límites colindan con los distritos de Tlacolula y Villa Alta al poniente, con Yautepec y Tehuantepec al sur, con el distrito de Juchitán al oriente, con el distrito de Choapam al norte y con el estado de Veracruz al noreste. Su extensión es tan grande que abarca parte de la Sierra Alta, Sierra Media y el Bajo Mixe, de 100 a 300 msnm aproximadamente.
El origen del pueblo mixe se remonta antes de la llegada de los españoles y requiere mayor espacio para referir su historia.
El templo original fue construido en el siglo XVII, pero sufrió varias intervenciones, por lo que poco o nada queda del primero. El templo actual ocupa el mismo sitio que su antecesor, así como parte de sus muros. La planta arquitectónica es de cruz latina, conformada por los siguientes espacios interiores: del acceso se pasa directamente a la nave principal, ya que en este templo no se construyó el coro o no se reconstruyó; este espacio está cubierto por bóveda de cañón.
A continuación se encuentra el crucero, donde se encuentra la cúpula de gajos sobre un alto tambor. Finalmente se llega al presbiterio. Los brazos del crucero son semejantes entre sí y están cubiertos por bóvedas de cañón; sobre el costado derecho del presbiterio se encuentra la sacristía.
Los materiales con los que está construido son tojos, los muros con piedra de la región asentada con mezcla de cal-arena y todas las cubiertas con estructura y losas de concreto armado.
La fachada principal es reciente, formada por la portada y dos torres de dos cuerpos con campanario, doble arco, cupulín y remate. La portada a su vez es de dos cuerpos con remate; al centro se encuentra el vano de acceso con arco de medio punto y en el segundo cuerpo la ventana coral. A sus lados se colocaron un par de columnas con nichos vacíos entre ellas.
En el interior no se cuenta con imágenes ni esculturas de santos.
