Tonaltepec era una comunidad mixteca menor en el momento del contacto.
Un conquistador y vecino de Antequera, llamado Bartolomé de Astorga, tuvo Tonaltepec y Zoyaltepec hasta 1540, cuando murió y la encomienda pasó al rey.
El templo de Santo Domingo Tonaltepec es de una nave cubierta con bóveda de cañón con lunetos.
Su estructura ha sido gravemente dañada por los frecuentes sismos que azotan la región.
La torre del lado norte de la portada se desplomó, quedando únicamente parte de su basamento y del muro circular de su escalera. Hacia el sur de la misma está el bautisterio, gravemente agrietado.
La portada se desarrolla en dos cuerpos y remate, separados en tres calles por pilastras de capitel toscano. Al centro del primer cuerpo se ubica el acceso de medio punto, con enmarcamiento decorado con motivos vegetales y dos angelitos sobre roleos en las enjutas, y en el segundo, la ventana coral mixtilínea en forma de estrella. Cada intercolumnio tiene dos nichos avenerados y solo dos de ellos tienen escultura; estas son de los arcángeles san Rafael y san Miguel.
