Antiguamente, el conjunto correspondiente al santuario comprendía gran parte de la ladera del cerro, donde los peregrinos acampaban a su paso. En las últimas décadas, con la extinción de las tradiciones del Señor de la Columna, el sitio ha sido invadido por asentamientos irregulares a su alrededor.
El conjunto tiene un pequeño atrio, con su arco de medio punto en el acceso atrial, remate curvilíneo y barda perimetral curvilínea coronada con pináculos. Dentro del atrio se encuentra un pozo artesiano, cuyas aguas son consideradas por los fieles que asisten a la feria preparatoria a la Semana Santa como poseedoras de virtudes. La fachada es del llamado barroco popular, con pilastras adosadas y cornisas de remate que flanquean un nicho aconchado, el cual protege una tosca escultura de bulto.
A ambos lados se levantan dos torres simétricas, formadas por dos cuerpos cada una, con un vano en cada lado y adornos verticales y horizontales a base de molduras, terminación en las esquinas con pináculo y un remate semiesférico adornado con cerámica, a la que se adherían monedas de plata.
La planta es de cruz latina, cubierta con bóveda de cañón soportada por arcos interiores. En el presbiterio se levanta la cúpula circular, con linternilla apoyada sobre tambor poligonal que tiene ventanas rectangulares para la iluminación del interior. La cubierta de las capillas laterales es a base de bóveda de lunetos. La sacristía, en la parte posterior del muro testero de ábside plano, es de menor altura y está techada con bóveda de cañón.
Adosados a los muros interiores se encuentran pinturas, nichos y esculturas de bulto.
El centro tradicional del pueblo fue el santuario del Padre Jesús, que tiene su templo dentro de una elevación del terreno, formando parte del conjunto de singular prestancia. Las características del santuario indican que su construcción se realizó probablemente en el siglo XVII, cuando surgieron las cofradías a la sombra de las industrias, con la fundación de la hacienda de Cuauhtepec.
