La disposición general del templo sigue la forma de cruz latina: el brazo mayor lo ocupa la nave, los brazos laterales dan lugar a sendas capillas y el último brazo aloja al presbiterio.
En la nave se dispuso una bóveda semicilíndrica de cañón corrido, al igual que en los brazos, pero con lunetos; así como en el sotocoro, pero su perfil es escarzano. El arco que recibe el borde hacia la nave se apoya en sendas impostas.
El coro alto se cubrió con una bóveda vaída, al igual que en el crucero. A ambos lados del presbiterio, los espacios interiores se complementan: a la izquierda, con la sacristía, y a la derecha, con la capilla del Santísimo (esta de reciente construcción), la cual se cubre con un cañón corrido de perfil escarzano.
En el aspecto exterior, el templo refleja claramente esta disposición. La portada adopta un lenguaje austero y contenido, con acentos de arquitectura popular; combina elementos aplanados con formas de cantera en jambas, arco, entablamento y el frontón quebrado, que constituye la base formal. Arriba, una hornacina con la imagen de San José prosigue con un óculo que disimula un vano cuadrangular sobre el coro y un remate con cornisas de trayecto sinuoso y escalonado.
Los comienzos del actual templo de San José se originaron en los primitivos métodos de evangelización de las órdenes religiosas. Fue una fundación jesuita, construida por los habitantes del pueblo de Jalatlaco entre 1588 y 1594.
Resultó afectado por los terremotos de 1603, 1604 y 1608, y destruido por el sismo de 1616, quedando abandonado por muchos años.
A comienzos del siglo XVIII, el obispo fray Ángel de Maldonado propuso reedificar el templo y construirle un convento anexo.
Se comenzó la obra en 1720 y fue continuada por el vicario capitular Félix Valverde hasta su conclusión en 1728, fecha que coincide con la muerte del obispo Maldonado. El templo fue consagrado bajo su advocación original en junio de ese mismo año, con sermones y grandes festejos religiosos.
DESCRIPCIÓN de LAS PORTADAS:
Portada principal.
El acceso principal está formado por un vano que remata en arco de medio punto, formado por dovelas que, en su parte frontal, tienen canaladuras laterales. Su clave pinjante tiene una decoración en relieve de tipo modillón; sus enjutas presentan un acanalado en su perímetro. Flanqueando el acceso, dos pilastras con canaladuras en sus laterales rematan en capiteles. La arquitrabe es de tres pequeñas bandas; el friso es liso, coronado por un cornisamiento. En la parte superior se aprecia un frontón roto que, en su tímpano, lleva una hornacina sobre un pequeño cornisamiento enmarcado por dos pilastras y su entablamento, decoradas en su fuste por pequeños rosetones unidos con un cordón. El entorno de la hornacina tiene relieves y, en su interior, se aloja la escultura de San José. Siguiendo el eje de las pilastras se encuentran dos pináculos; más arriba se ubica un óculo de forma circular con marco liso, terminando en su interior la ventana del coro en forma cuadrada. El remate de la portada concluye con un elemento denominado "Universidad de Breslavia".
La portada lateral se ubica en el muro lateral, lado norte. Esta es de un solo cuerpo, donde se ubica el acceso, formado por un vano que remata en un arco de medio punto, formado por dovelas y clave al centro. Flanqueando el acceso, dos pilastras rematan en capiteles; su arquitrabe es de tres pequeñas bandas.
Su friso es liso, terminando con un frontón roto que, en su tímpano, presenta un repisón donde se ubica la escultura de una virgen alojada en una hornacina, con su remate en forma de concha decorada por pequeños relieves en forma de hojas y pequeños pináculos. Siguiendo el eje de las pilastras, rematan la portada dos pináculos fabricados con mortero.
